既然无法在战场报效国家，魏源自然不会辜负期望。在扬州的家中，他开始废寝忘食，一门心思地专心写作，以探索抗敌御侮的良策……
到了五十二岁的那年，经过了候补殿试，魏源终于成为了三甲中的九十三名进士一员，即便如此，据说当时的考官还嫌他的考卷上字迹过于草，有伤斯文，曾取消了他殿试的资格。
不管怎么样，魏源得以由此正式进入了“大清”的官场，虽然年岁不饶人，可总有施展一番拳脚的舞台了。
在跻身进士行列的第二年，魏源被放任江苏扬州府的东台县知县。不久又因母丧辞官回家，曾在江苏巡抚陆建瀛的衙署中充当幕僚，借以游历了东南各省，并到香港、澳门广泛收集资料，为继续充实《海国图志》作准备。
此后，魏源又出任兴化知县。一年之后，升任高邮州的知州。在这段时间里，他不仅筹划海运，兴修水利，改革盐政，还于担任知州的第二年，即天历一八五二年，终于完成了他的百卷本鸿篇巨著——《海国图志》。在《海国图志》补充的部分里，尽管魏源还图文并茂地向他想象中的读者们介绍了各地研制和改进战船、火炮、鸟枪、火药、地雷、水雷等等的情况，可惜的是，《海国图志》依旧是少人问津。
“大清的大地上”最盛产的不识字的人，自然对它丝毫没有兴趣，而fēng_liú倜傥的“大清”的知识精英们，却往往喜欢更多地关心自己的“前途”，根本就对那些于己无关的外部世界毫无**。
“好日子”总是犹如过眼的烟云，来也匆匆，去也匆匆。就在魏源刚刚坐满两年的知州，金田那里一路杀来太平军，就以摧枯拉朽之势攻下了金陵、镇江和扬州。在高邮，响应太平天国这场大革命的农民们也是风起云涌。
对于这场一脑袋草根的泥腿子们所发动的大革命，魏源是切齿的痛恨。他不仅在高邮带着捕快到处捕杀煽动闹事的农民领袖，还极尽鼓吹之能事，劝导乡绅组建团练，发誓要与太平天国对抗到底。
对于魏源的这种精神，他的同僚乃至上官似乎并不买账。没有多久，魏源即遭上官的诬告，被清廷革职。“无官一身轻”的他先是躲到了泰州，虽然不久就又有人开始向上保奏他官复原职，但此时经过了数月冷静的他，已经清楚地意识到了，在太平军的席卷下，腐朽不堪的清王朝绝无振兴的希望。因此，心灰意冷的他，一面拒绝再替清廷做犬马，一面赶紧逃去了杭州。
在兴化西寺，他寄居僧舍，静坐参禅，拒见任何来客。
“唔……”
也不知道过了多久，一声低微的长吟打断了林海丰的思绪。
“魏老先生，身体感觉好点儿吗？”林海丰赶紧俯身过去，一面为刚刚微睁开双眼的病人轻轻抚揉着心口，一面笑着问到。
“林……林委员啊……老夫……老夫……”